先日，ブログのアップデートについて2回に分けてまとめたが（How to update hugo and academic theme (Part1), How to update hugo and academic theme (Part2)），読み直してみるとhugoとacademic themeの全体的なアップデートのことで終わっていて，具体的な内容のアップデートについてはあまり書いていないことに気がついた．そこで，今回はその辺の細かいところについて，後日の自分のためにも，まとめておくことにした．今回の内容に関しては，ox-hugoのレベル，つまり，org-mode file ではどうすれば良いのか分からず，直接マークダウンファイルを弄らざるを得ない事が多かった．
前回（How to update hugo and academic theme (Part 1)）にhutoとacademicのアップデートをまとめたが，やはり，githubにdeployするときのエラーが，どうしても気になる．そこで，今回は，Academic themeのインストールを一からやり直すことにした． Hugoとox-hugoのインストールやアップデートは前回の記事（How to update hugo and academic theme (Part 1)）を参考にしていただきたい． <!–more–> Table of Contents References Install Academic Kickstart with Git Migrate Content References Install Academicご本家の解説 Update Academicご本家の解説 Install Academic Kickstart with Git やはり，公式ドキュメントに従うのが良いだろうと考え，上記のリンク先のInstallの解説の通りにしてみた．git submoduleを使うので，よく分からんと敬遠していたのだが，やってみると（作業自体は）簡単であった． Git submodule の基礎 によれば，「git submodule は、外部の git リポジトリを、自分の git リポジトリのサブディレクトリとして登録し、特定の commit を参照する仕組み」である． 1. まず，Academic Kickstart repository を自分のウェブサイトを作るためにクローンする． {{% alert note %}} またも間違っていた．上述の公式ドキュメントにはちゃんと，Fork the Academic Kickstart repository to create a new website と書いてあったのに読み過ごしていた． {{% /alert %}} ということで，まず，academic-kickstart に行って，右上の Fork ボタンを押して，自分のgithub pageにacademic-kickstartのrepositoryを作成する． ついで，この自分のgithub pageのforkをgit cloneで自分のサイトにクローンする． $ pwd /Data/MyBlog $ git clone https://github.
最近のニュースを見ていて思い出した言葉がある．
“True patriotism hates injustice in its own land more than anywhere else.” ― Clarence Darrow
“Patriotism is the last refuge of a scoundrel.” ― Samuel Johnson
“Violence is the last refuge of the incompetent.”” ― Salvor Hardin ( Isaac Asimov)
3番目はオマケ
閑話休題，以前の記事（How to add horizontal scrollbar for codeblock in academic theme of hugo）で触れたように，このブログは，Hugoという静的サイトジェネレーター（themeはacademic）で作成している．
世はゴールデンウィークまっただ中である．完全な10連休ではないが，それなりに長い休みとなるので，この機会に，ようやく Sierraから Mojave にupgradeすることにした．ついでにEmacsも26.1から 26.2にupgradeした．今回は，このupgradeの際に遭遇したトラブルについてまとめる．
Table of Contents Upgrade to Mojave from Sierra Upgrade to Xcode 10.2.1 Upgrade to Emacs 26.2 from 26.1 LaTeX pdfにフォントが埋め込まれているかどうかを確認する方法 感想 Upgrade to Mojave from Sierra Ref: macOS Mojave にアップグレードする方法
結論から言うと，拍子抜けするぐらい簡単であった．AppStoreで適当にクリックするとすぐにMojaveがダウンロードされて，インストーラーが起動した．これをクリックしてインストールを始めると，此処から先は完全自動状態で，ひたすら待った．というか，違うことをしていた．何回も再起動していたようだが，実際には1時間ぐらいで終了したような気がする．手間いらずであった．R, Rstudio, ImageJ, Emacs, LaTeXが動いて画像編集，動画編集ができれば，とりあえず文句はないので，まずそのあたりをチェックしてみると，R, Rstudio, ImageJ, 画像編集，動画編集は問題なく動いた．EmacsとLaTeXについては以下に述べる．
Upgrade to Xcode 10.2.1 早速brewでemacsをupgradeしようとしたのだが，xcodeが古いと叱られたので，まず，xcodeをApp Storeからupgradeした．そして brew install すると以下のようなエラーが出る．
$ brew install hogehoge ......... xcrun: error: invalid active developer path (/Library/Developer/CommandLineTools), missing xcrun at: /Library/Developer/CommandLineTools/usr/bin/xcrun これは，「macOS を Mojave にあげた後に Homebrew を使うとエラーが出る問題」にあるようにcommand line developer toolsを再インストールすれば直る．同サイトに詳細が記載されている．