またまたRネタである．グラフに注釈をつけたくなることがあるが，なかなか見映えのする注釈をつけるのは難しい．最近，それなりの方法を見つけたので，まとめておく．例として，代謝経路の変化を縦型の折れ線グラフで描きKEGG orthologyによって分類したグラフを作成してみる．うーむ，自分で書いていてなんだが，マニアックなネタである．．．(^^;;;
（承前）前回（How to automatically embed R plot into html exported by org-mode with org-babel）はorg-babelを設定して，Rで描いたグラフを自動でhtmlやpdfに挿入するところまでまとめた．繰り返しになるが，本サイトは，ox-hugoで書いてHugo用のMarkdownをexportすることにより作成している．前々回の記事（How to plot survival curve of competing risk analysis with censoring mark and number at risk (at risk table)）を書いている際に，Rでplotしたgraphをブログ記事の中に自動ではめ込むよう設定するのに苦労した．前回でorg-babelの設定は終わっているので，今回は，Hugoやox-hugoの設定に関してまとめ，ブログ記事へのR plotの自動挿入ができるようにする．
Table of Contents References Configuration of Hugo section Setup of HUGO_SECTION & HUGO_BASE_DIR in ox-hugo References to files outside the static directory References HUGO Hugo is one of the most popular open-source static site generators. With its amazing speed and flexibility, Hugo makes building websites fun again.
本サイトは，ox-hugoで書いてHugo用のMarkdownをexportすることにより作成しているが，前回の記事（How to plot survival curve of competing risk analysis with censoring mark and number at risk (at risk table)）を書いている際に，Rでplotしたgraphを記事の中に自動ではめ込むよう設定するのに苦労したので，これも忘れないうちにまとめておく．まず，今回はorg-babelの設定について書き，次回にHugoでの設定をまとめる．
Table of Contents Org-babel setup How to use org-babel Org-babel evaluation of R code block Org-babel setup org-babelとは，う～～～ん，なにもの？ ものすごく端折って言うと，Code blockを評価して結果を表示するorg-modeの拡張，といったところだろうか．．．実例を見たほうが早いと思う．今回，org-babelによる R code の評価について書こうとして，ふと，ブログを見直してみると，なんとorg-babelの設定をまとめた記事を投稿してない …..(^^;;;
ということで，org-babelの設定を改めて記しておく．例によって，init.orgに以下のように書き込んでおけばよい．
Ref: Org-babel Setup ここからコピペ (^^;;;
#+begin_src emacs-lisp (org-babel-do-load-languages (quote org-babel-load-languages) (quote ((emacs-lisp . t) (dot . t) (ditaa . t) (R . t) (python . t) (ruby .